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【CELL DISCOV】汤富酬/付卫团队使用单细胞分析揭示了小肠腺癌恶性表型和
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作者:Mia
导读:小肠腺癌(SBA)是罕见的恶性肿瘤,死亡率高,目前对其分子特征的探索较为缺乏。最近,有研究团队对12名SBA患者的肿瘤样本进行单细胞RNA测序,提供了SBA中肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞的分子特征的蓝图,并揭示了其临床治疗的潜在靶点和犯罪片候选药物。
9月14日,汤富酬和付卫团队在Cell Discovery上共同发表了一篇题为“Single-cell profiling reveals molecular basis of malignant phenotypes and tumor microenvironments in small bowel adenocarcinomas”的研究论文。该研究对12名SBA患者的肿瘤样本进行单细胞RNA测序,提供了SBA中肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞的分子特征的蓝图,并揭示了其临床治疗的潜在靶点和候选药物。
研究背景
01
小肠腺癌(SBAs)是一种罕见的胃肠道癌症,预后不良。超过一半的sba起源于十二指肠,25%-29%起源于空肠,10%-13%起源于回肠。虽然小肠占整个胃肠道长度的75%,但小肠肿瘤只占所有胃肠道肿瘤的2% ,这表明小肠发生癌变具有其独特机制。
相对于胃癌(GC)和结直肠癌(CRC),SBA的发生率较低,但尚不清楚其内在原因。目前推测上皮细胞的快速周转、饮食物质的快速传递、低细菌负荷、淋巴组织的高聚集水平和相对碱性的环境可能是SBA发病率低的部分原因。此外,由于SBA的病理研究较少,SBA的化疗方案通常以CRC的治疗为参考,缺乏针对SBA的特异性药物。
基因组研究揭示了SBA与GC和CRC不同的特征。然而,关于SBA转录组的研究较少,SBA的诊断和预后需要更多特异性的标记物。以往对SBA的基因组研究主要基于体块组织测序数据,揭示了肿瘤组织中肿瘤细胞和微环境细胞的平均特征,对SBA的瘤内异质性和细胞类型组成没有进行全面的研究。
研究概述
02
由于关于SBA的知识和可用数据有限,研究团队将CRC研究的外推用作治疗SBA的主要参考。
首先,研究人员确定了4种流行的恶性细胞亚型:细胞周期程序,线粒体程序,代谢程序和EMT程序。这4种恶性细胞亚型的进展轨迹是从细胞周期程序到线粒体程序,并进展到代谢程序或EMT程序。这一发现代表了SBA恶性细胞的肿瘤内异质性,而scRNA-seq策略是分析肿瘤内异质性的理想选择。
在肿瘤免疫微环境中,研究人员发现EMT程序恶性细胞与高度耗尽的CD8 T细胞具有高相关性。EMT程序恶性细胞与高度疲惫的T细胞之间的相互作用可能揭示恶性细胞的EMT特征与SBA中T细胞衰竭之间的关联。
scRNA-seq分析揭示的SBA的细胞景观
此外,研究人员利用已发表的其他胃肠道癌的scRNA-seq数据,比较了胃癌、十二指肠癌、空肠癌和结直肠恶性细胞在全局基因表达水平上的相关性。他们发现SBA的十二指肠亚型表现出与GC更相似的分子特征,而SBA的空肠亚型更类似于CRC。
研究人员还通过使用已发表的组学和药物反应数据,筛选出14种用于SBA治疗的潜在药物。根据细胞活力实验,进一步证实了其中Volasertib和 Tozasertib 对十二指肠癌细胞系表现出比常规SBA药物更强大的抑制作用。
研究总结
03
总之,研究系统地分析了 SBA 中恶性肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞的特征,揭示了病理表型的标签、恶性肿瘤细胞和微环境细胞标签之间的联系以及具有相关靶标的候选药物。SBA 少见但病死率高,因而大规模临床试验难以开展。EMT 程序恶性细胞和高度耗竭的 T 细胞之间增强的细胞间相互作用可能为 SBA 的免疫治疗提供线索。
参考资料:
注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。
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