吉赛德：中国5省份流行的奥密克戎毒株基因测序公布

　　全球公共数据库吉赛德（GISAID）公布了截至2022年12月27日，来自中国的奥密克戎毒株的基因序列数据。

　　

　　虽然目前仅仅得到了北京、福建、广东、内蒙古和四川等5个省份的奥密克戎毒株基因测序数据，并且样本数也不是很多，但是还是可以一窥目前国内流行的奥密克戎毒株的分布和演化的大概情况。

　　

　　先看一下中国流行的BF.7毒株的基因测序数据情况：

　　1，北京在过去2个月上传23例：2022年11月17-19日报告5例；在2022年12月6日报告16例；

　　2，内蒙古在过去2个月上传9例：其中6例都是2022年国庆期间报告的。

　　3，福建在过去2个月上传14例，全部是2022年12月报告的。

　　4，四川在2022年12月24日上传3例。

　　5，这里没有看到广东有上传BF.7毒株的数据。

　　

　　下面看下BA.5.2毒株的基因测序数据情况：

　　1，北京在2022年12月6日上传了4例；

　　2，福建在整个2022年12月一直在报告，一共有22例；

　　3，广东在2022年10-11月报告了8例；

　　4，四川在2022年12月24日上传了6例；

　　5，过去2个月内蒙古没有报告BA.5.2毒株。

　　

　　在这5个上传数据的省份里，有3个省份的数据还是比较有代表性的，首先是北京和福建省，上传的数量是最多的：

　　1，北京BF.7是23例，BA.5.2是4例；

　　2，福建BF.7是14例，BA.5.2是22例。

　　其次是四川省，因为都是2022年12月24日的数据：

　　BF.7是3例，BA.5.2是6例。

　　这些数据和媒体报道目前中国8成以上是BF.7和BA.5.2毒株感染是吻合的。不过样本数量太少，具体的比例很难估计。从媒体报道的数量来看，国内可能BA.5.2还是居多。

　　大陆综艺

　　GISAID是一项全球数据科学计划，也是所有流感病毒，呼吸道合胞病毒和新冠病毒的基因组和相关元数据的主要来源。GISAID的可公开访问的数据共享平台使来自198个国家的42000多名参与研究人员和全球3500多个机构的数据生成器能够进行协作。

　　在过去的180天里，中国已经与GISAID进行了测序和分享了412例新冠病例，而美国分享了超过576000例。在新冠病例基因数据库中，英国分享了近12%，美国分享了4%以上，中国目前贡献不到1%。当然，这和我国过去三年封控导致新冠病例数量少有关。

　　

　　中国疾控中心病毒病所所长许文波表示，12月1日以来，全国已经完成1142例病例的全基因组测序。所以已经上传到GISAID的数据只有不到10%。随着中国疫情的放开，会有越来越多中国的数据公开，以应对数亿规模的新冠感染的监测和公共卫生管理。