2022年度国内十大科技新闻揭晓！西南大学绘就家蚕超级泛基因组图谱入选

　　原标题：2022年度国内十大科技新闻揭晓！西南大学绘就家蚕超级泛基因组图谱入选

　　

　　12月23日，2022年度国内、国际十大科技新闻揭晓， “中国科学家绘制完成世界首张千蚕高精度基因遗传变异图谱”成功入选“2022年度国内十大科技新闻”。据悉，世界首张千蚕高精度基因遗传变异图谱由西南大学蚕学科研团队历时四年绘就，该项成果发布以后，在国际学术界反响热烈，开启了家蚕分子育种的新纪元。

　　

　　△家蚕生命周期各阶段丰富的表型多样性

　　来源：西南大学

　　“此次能够入选，我们深感荣幸、倍受鼓舞。2022年我国科技界包括农业科技领域有众多好成果产生，这项在Nature子刊发表的家蚕科研成果能够脱颖而出，表明曾一度‘唯刊论’的评价问题得到根本改观，我国科技界的价值取向趋于更加理性，这增加了我们科技工作者的信心。”西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授感慨地说道。

　　代方银表示，超级泛基因组是一个物种所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖更多的遗传多样性。因此，绘就家蚕超级泛基因组图谱，对深化功能基因组研究、种质创新等意义重大。

　　为了全面反映桑蚕的所有基因组信息，从2018年开始，该研究团队就提出了“千蚕基因组”计划，接着组织核心成员讨论了项目的整体框架和思路，开展测序预实验，确定项目实施方案。

　　“为了尽可能获得能覆盖桑蚕整个物种多样性的样本，从2019年春季开始，基于拥有的世界规模最大的家蚕基因库（覆盖全球90%以上家蚕遗传变异资源）这个自身优势条件进行取材，我们再联系各地蚕桑研究单位对材料类型进行查漏补缺，最终确定1078份桑蚕材料，包括47份祖先种野桑蚕（覆盖野桑蚕在中国的所有分布区域）、205份家蚕地方种（世界各地经长期驯养保存但未继续选育的家蚕品系）、194份家蚕实用种（经济性状改良后的实用品种）和632份家蚕突变系。”代方银介绍，材料涵盖了家蚕各种遗传资源类型。

　　2019年8月，项目组代方银教授、童晓玲教授等亲赴西藏高原搜集此前从未被发现过的西藏野桑蚕用于项目研究，对于组装高质量的野桑蚕基因组起到了关键性作用。其间，童晓玲教授为首次进藏，经受了严重的高原反应，飞机从重庆出发抵达邦达机场，一下飞机不久，她强烈呕吐，头晕目眩，极为难受。但她在昌都作短暂休整之后，仍然坚持翻山越岭，奔赴八宿、左贡、芒康、巴塘、盐井等地，颠簸于“七十二道拐”，途经5100多米高海拔，坚持到取得珍稀材料为止。这种不达目的不罢休的顽强精神，使项目组深受鼓舞。

　　最终，该研究团队对1078份各类蚕种质资源进行了深度二代测序，并对其中545份代表性资源进行了三代测序，鉴定4300余万个SNP（单核苷酸多态性）、930余万个Indel（插入缺失标记）、340余万个结构变异和7308个新基因（家族），由此绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。

　　

　　△ 家蚕泛基因组项目负责人代方银教授（坐者）与成员讨论实验结果。

　　图片来源：西南大学

　　2022年9月，该项目主体研究论文正式在Nature Communications发表。这项成果的取得，推动蚕学研究步入高速发展阶段，开启了家蚕分子设计育种新纪元。此外，家蚕是鳞翅目害虫研究模式和生命科学新型模式生物，对于昆虫学乃至生命科学的发展也具有积极意义。

　　“未来，我们团队的一个重点研究方向是家蚕优异性状基因挖掘与分子设计育种。包括构建和开放家蚕超级泛基因组数据库，支撑科学研究快速发展；系统挖掘家蚕育种性状基因和有益变异，推动优异基因向育种应用转化；开发基于泛基因组的设计育种新技术，提升家蚕育种水平；创建高产、优质、强健及特殊性能育种新材料，推动家蚕多元化、多功能开发；培育综合优良性状突破性家蚕品种，支撑产业高质量发展等。我们将以此次入选‘2022年度国内十大科技新闻’为契机，大力弘扬科学家精神，肩负起历史赋予的科技创新重任，把自己的科学追求融入建设社会主义现代化国家的伟大事业中去。”代方银教授说。

　　来源：重庆科技报

　　编辑：陆琳玥

　　审核：李彦霏

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