机器学习模型可预测未来主要流行株，携带突变位点或引发自身免疫性肝炎丨新冠研究一周

　　

　　来源：科技日报、环球科学、中国科讯、科研圈、Hanson临床科研等

　　3剂mRNA疫苗对奥密克戎主要亚型均有效

　　

　　来源：bioRxiv

　　近日，发表于预印本bioRxiv的一项研究显示，3剂mRNA疫苗接种对奥密克戎最具传染性的3个亚型依然十分有效。

　　研究首先通过应用BA.4，BA.5，BA.2.12.1等假病毒感染293T-ACE2和CaLu-3细胞系，发现它们感染293T-ACE2细胞能力增强，但结合人肺腺癌细胞系CaLu-3的能力下降。进一步评估疫苗接种者的血清，研究结论表明，3剂BNT162b2或者mRNA-1273接种对奥密克戎变异株及其亚型依然十分有效。

　　https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.16.492158v1.full.pdf

　　感染后再接种新冠疫苗可降低“长期新冠”发生率

　　

　　来源：BMJ

　　近日，发表于《英国医学杂志》（BMJ）的一项大型观察性队列研究发现，感染后再补救接种疫苗可以将“长期新冠”发生率稳定降低8.8%。

　　在发生感染后，如果接种一剂疫苗（BNT162b2或AZD1222）可以将“长期新冠”发生率降低12.8%，但是其长期效果不稳定。第二剂接种后可以将其概率降低8.8%，长期效果稳定。研究人员指出，对感染者而言，感染后接种疫苗是降低“长期新冠”发生的可行方法。

　　https://www.bmj.com/content/377/bmj-2021-069676

　　突破感染奥密克戎变异株后，疫苗接种者体内产生了潜在的交叉反应抗体

　　

　　来源：Cell

　　5月19日，发表于《细胞》（Cell）的一项研究显示，以完成疫苗接种但仍感染奥密克戎变异株的患者体内，存在一种能广泛中和不同变异株的强效受体结合结构域（RBD）抗体。

　　研究团队比较了奥密克戎BA.1、BA.1.1和BA.2的中和作用，发现奥密克戎BA.2亚型RBD的ACE2亲和力比BA.1略高，疫苗血清的中和作用略低，可能与其传播性增加有关。进一步对分离出的27种强效RBD结合的mAb进行结构和功能分析，发现它们集中在RBD内的两个主要集群中，27种mAb都能有效地中和早期的大流行毒株，而且许多抗体对VoC显示出广泛的反应性。

　　https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00598-0#relatedArticles

　　雾化吸入疫苗Ad5-nCoV展示出非常强的免疫活性

　　

　　来源：The Lancet Respiratory Medicine

　　5月20日，发表于《柳叶刀·呼吸病学》（The Lancet Respiratory Medicine）的一项研究显示，作为加强接种疫苗，中国康希诺研发的雾化吸入Ad5-nCoV疫苗展示出非常强的免疫活性和良好的安全性。

　　研究发现，在2剂CoronaVac灭活病毒疫苗接种的基础上，以吸入型Ad5-nCoV腺病毒载体疫苗作为异源加强接种安全性良好；与CoronaVac同源加强接种相比，吸入式Ad5-nCoV能够诱导出更高的血清中和抗体和RBD-IgA抗体。

　　https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(22)00087-X/fulltext

　　AI可帮助诊断新冠感染后的肺部特殊问题

　　

　　来源：Nature Machine Intelligence

　　5月23日，发表于《自然·机器智能》（Nature Machine Intelligence）的一项研究，开发出了一款新的计算机辅助诊断工具DLPE，该人工智能系统可以帮助应对新冠病毒感染患者肺部健康时其他手段无法识别出的肺部问题。

　　研究团队利用数千名新冠肺炎住院患者的胸部CT扫描数据训练和验证其算法，在专业放射科医生的帮助下完善了该算法，然后将其应用于数十名肺部有问题的新冠病毒幸存者。该工具可以揭示冠状病毒感染者的肺纤维化迹象，有助于解释呼吸短促、咳嗽和其他肺部症状。

　　https://www.nature.com/articles/s42256-022-00483-7

　　携带突变位点的新冠病毒可能引发自身免疫性肝炎

　　

　　来源：bioRxiv

　　5月23日，发表于预印本平台bioRxiv的一项研究（未经同行评审）发现，感染携带有ORF1ab1056-1062（VVVNASN）突变位点的新冠病毒毒株可能通过“表位模拟”引起患者自身免疫性T细胞反应。

　　研究人员通过HLA结合预测工具，评估来自人类PARP14和新冠病毒ORF1ab的高相似肽对HLA分子的结合潜力，发现人类PARP14中的多肽VVNASNELK和ORF1ab1056-1062中的多肽VVNASNVYK可以由相同的HLA-A*11:01分子提呈，突变后的ORF1ab1056-1062对HLA-A*11:01分子的结合能力增强。结果表明，具有高度序列同源性的自体多肽和病毒多肽可能由同一HLA分子提呈，这支持了特异性T细胞可能被病毒多肽激活，并引起自身免疫反应。

　　https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.16.491922v3

　　英国奥密克戎BA.2的流行呈现4个特征

　　

　　来源：Science

　　5月24日，发表于《科学》（Science）的一项研究，针对英国奥密克戎突变株的流行病学研究，特别对BA.2做了重点解析。

　　该研究通过PCR监测英国新冠病毒感染率的全国数据，发现奥密克戎BA.2流行期间，英国感染率为历次疫情感染率最高；人口多、尤其是有孩子的家庭更容易出现感染，乡村及贫困人群在BA.2疫情中感染率低于高收入人群；老年人的感染增长最为明显，但在疫苗的保护下，相对前峰仍低；奥密克戎突变株的毒株竞争优势非常明显高于之前毒株德尔塔。这表明，一老一小的新冠预防和疫苗接种，仍然是重中之重。

　　https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq4411

　　接种疫苗可使由新冠导致的死亡风险降低34%

　　

　　来源：Nature Medicine

　　5月25日，发表于《自然·医学》（Nature Medicine）的一项研究表明，与未接种新冠疫苗的新冠感染者相比，接种疫苗可以使由新冠导致的死亡风险降低34%，也可以使患有“长期新冠”的风险降低15%。

　　研究发现，接种过疫苗但出现突破性感染（接种疫苗14天后，新冠病毒检测呈阳性）的人中有8%~12%会发展为长期新冠；其中，具有免疫缺陷的人群患上长期新冠的风险更高。但总体来说，接种疫苗能有效抑制由长期新冠导致的肺部疾病（降低49%）和凝血障碍（降低56%）。

　　https://www.nature.com/articles/s41591-022-01840-0

　　辉瑞公布6个月至5岁儿童新冠疫苗研究结果

　　5月23日，辉瑞-BioNTech报道了儿童剂量BNT162b2在6个月至5岁儿童2/3期临床试验结果。

　　研究给予了1678名6岁以下儿童3剂3 μg BNT162b2，发现该疫苗在儿童中耐受良好，安全性与安慰剂组相当。在奥密克戎流行期间，截至4月29日，3剂3 μgBNT162b2接种在该年龄组的保护力为80.3%。辉瑞已向FDA提交EUA申请。

　　https://www.pfizer.com/news/press-release/press-release-detail/pfizer-biontech-covid-19-vaccine-demonstrates-strong-immune

　　机器学习模型可预测下一个新冠主要流行株

　　

　　来源：Science

　　5月24日，发表于《科学》（Science）的一项研究中，报告了一种机器学习模型，能够分析数百万个新冠病毒的基因组，然后估计其中哪一个变异株有可能成为主要流行毒株，从而引发新一轮疫情。

　　研究人员使用来自GISAID数据库中600多万个新冠病毒的基因组，来训练这款机器学习模型，并将这个模型命名为PyR0。结果发现，经过训练后，PyR0能够评估基因突变对病毒复制和传播能力的影响。但PyR0却能同时分析所有公共可用的关于新冠病毒的数据，而且能在约1小时内分析数百万个基因组。未来研究人员将着重于研究哪些基因突变变得越来越常见，然后评估每一种突变会如何影响病毒的传播速度。

　　https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm1208

　　《科技导报》创刊于1980年，中国科协学术会刊，主要刊登科学前沿和技术热点领域突破性的成果报道、权威性的科学评论、引领性的高端综述，发表促进经济社会发展、完善科技管理、优化科研环境、培育科学文化、促进科技创新和科技成果转化的决策咨询建议。常设栏目有院士卷首语、智库观点、科技评论、热点专题、综述、论文、学术聚焦、科学人文等。